В  1992—1995 годах с  благословения Патриарха Алексия II была осуществлена недопустимая с точки зрения охраны архитектурного наследия реконструкция храма.

Церковь получила новую трапезную и колокольню. После их сооружения площадь храма увеличилась более чем вдвое, но он не только лишился своих пропорций, но и скрыл красивейший усадебный дом.

Была выполнена заново вся отделка интерьеров. Фасады и внутренние залы храма отделали мозаичными панно, абсолютно не вписывающимися в стилистику здания.

В результате осталась нетронутой  лишь  подкупольная часть храма.
Большинство искусствоведов считают, что перестройка храма испортила его первоначальный облик и уменьшила историческую ценность.

Однако это не помешало храму стать символом района Лианозово, запечатленным на его гербе.
Хорошо сохранился верхний Алтуфьевский пруд, до сих пор остающийся проточным.
 Здесь частенько можно встретить рыбаков с удочками,- пару раз видела выловленных ими крошечных рыбешек. Возможно, в их байках  эти мальки потом превращаются в огромных карасей.

Частично сохранился усадебный парк, в котором остались деревья, помнящие былых обитателей Алтуфьева. Сохранились достаточно редкие породы деревьев, например гигантский серебристый клен, пенсильванские ясени, канадские тополя.  Ближе к воде растут ракиты, березы, ветлы.

Очень нравится приходить сюда, неспешно прогуливаться  по дорожкам парка и представлять перед глазами возрожденную усадьбу  во всей её настоящей самобытной русской красе.